Protein sequence | ID you entered: ENSP00000168977 Ensembl protein: ENSP00000168977 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: NMRK2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: nicotinamide riboside kinase 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:17871] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs70883 | M173I | 1 | Melanoma | 21499247   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs146474422 | P76L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs140113877 | R117Q | Frequency |
| 3 | rs144659918 | V122I | 1000Genome |
| 4 | rs199941317 | V149L | 1000Genome |
| 5 | rs150918954 | G164S | Frequency |
| 6 | rs16992131 | E178K | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs138906846 | R181H | Cluster,Frequency |
| 8 | rs141476437 | S190* | Cluster |
| 9 | rs181454061 | R194C | 1000Genome |
| 10 | rs146981587 | P202L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 11 | rs148078582 | R213L | Frequency |
| 12 | rs150621748 | C215F | Cluster |
| 13 | rs35701787 | A223T | Cluster,Frequency,1000Genome |
No entry in dbDEPC was found |
| [ continue search ] |
Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li