Protein sequence | ID you entered: ENSP00000215582 Ensembl protein: ENSP00000215582 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: MISP | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: mitotic spindle positioning [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:27000] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs32955 | R565W | -3 | Head and Neck Cancer | 21798897   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs35093527 | Y31H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs145024685 | Y68* | 1000Genome |
| 3 | rs141160817 | S84L | Frequency |
| 4 | rs45477999 | A99T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs45591331 | G116R | Cluster |
| 6 | rs151208927 | R125H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs3746173 | S156G | HapMap,1000Genome,Cluster,Frequency |
| 8 | rs145204788 | T172I | 1000Genome |
| 9 | rs78455638 | R188T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 10 | rs144643054 | F200L | Frequency |
| 11 | rs189638901 | T219I | 1000Genome |
| 12 | rs147994311 | A230S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 13 | rs3746175 | K232R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 14 | rs74634086 | F234L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 15 | rs35384259 | S269N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 16 | rs138298423 | R311K | 1000Genome |
| 17 | rs34104245 | R314Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 18 | rs146641703 | R341Q | Frequency |
| 19 | rs141324306 | R342Q | Frequency |
| 20 | rs201182924 | S382* | Cluster |
| 21 | rs201182924 | S382L | Cluster |
| 22 | rs151311263 | R390W | Cluster,1000Genome |
| 23 | rs140196930 | R390Q | Frequency |
| 24 | rs144396442 | A392V | 1000Genome |
| 25 | rs150331658 | S394T | Frequency |
| 26 | rs137890735 | P410S | Frequency |
| 27 | rs199803304 | A453V | Cluster |
| 28 | rs200675895 | A458V | Cluster,Frequency |
| 29 | rs190920819 | K476E | 1000Genome |
| 30 | rs143026376 | R510W | Cluster,1000Genome |
| 31 | rs116993988 | G527D | 1000Genome |
| 32 | rs142890248 | R556H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 33 | rs139858549 | R556C | 1000Genome |
| 34 | rs141415846 | R565Q | Cluster,Frequency |
| 35 | rs184245064 | T577M | 1000Genome |
| 36 | rs185794418 | A617G | 1000Genome |
| 37 | rs8107847 | E653G | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 38 | rs184988190 | R656Q | 1000Genome |
| 39 | rs145524738 | T658N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 40 | rs143887834 | R667H | Frequency |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li