Protein sequence | ID you entered: ENSP00000252675 Ensembl protein: ENSP00000252675 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: FUT5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: fucosyltransferase 5 (alpha (1,3) fucosyltransferase) [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:4016] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs52836 | F85L | 0 | PF00852 | Head and Neck Cancer | 21798893   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs144284886 | R38Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs141146690 | R63P | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 3 | rs189234701 | A90T | 1000Genome |
| 4 | rs61731563 | R93H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs140525878 | D177N | Frequency |
| 6 | rs62625020 | G183S | Cluster,Frequency |
| 7 | rs62625020 | G183C | Cluster,Frequency |
| 8 | rs79852809 | P187L | Cluster |
| 9 | rs61734103 | P187L | Frequency |
| 10 | rs778970 | P187L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 11 | rs140776824 | P195S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 12 | rs61744945 | P195S | Frequency |
| 13 | rs137925088 | N212S | Cluster,1000Genome |
| 14 | rs145832499 | A228V | Frequency |
| 15 | rs148377456 | G236R | Frequency |
| 16 | rs28362466 | G236R | Cluster,Frequency |
| 17 | rs61730514 | K244Q | Frequency |
| 18 | rs143372058 | T250M | Frequency |
| 19 | rs149142282 | R253Q | Frequency |
| 20 | rs147659571 | Y257C | Frequency |
| 21 | rs28381968 | V283M | Frequency |
| 22 | rs61737302 | V283M | Frequency |
| 23 | rs145337594 | P299L | Frequency |
| 24 | rs141679775 | D301N | Frequency |
| 25 | rs61745631 | R317G | Cluster,Frequency |
| 26 | rs61734104 | H334R | Frequency |
| 27 | rs778984 | H334R | Cluster,HapMap |
| 28 | rs57100281 | H334R | Cluster |
| 29 | rs4807054 | T338M | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 30 | rs139123543 | R340Q | Frequency |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li