Protein sequence | ID you entered: ENSP00000255608 Ensembl protein: ENSP00000255608 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: BTBD2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: BTB (POZ) domain containing 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:15504] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.13817, hypergeometric test ) 24  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs62036 | G152R | -2 | PF00651 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs36020359 | V138I | Cluster |
| 2 | rs139660333 | M224V | Cluster |
| 3 | rs36020359 | V286I | Cluster |
| 4 | rs140547106 | A332T | Cluster |
| 5 | rs146791419 | S334L | Frequency |
| 6 | rs144730414 | S344N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs140995464 | I360T | Frequency |
| 8 | rs149364482 | S373I | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 9 | rs147228439 | V403M | Cluster |
| 10 | rs7253519 | D515E | Cluster,Frequency,1000Genome |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li