Protein sequence | ID you entered: ENSP00000262962 Ensembl protein: ENSP00000262962 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: CCDC94 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: coiled-coil domain containing 94 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:25518] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.724056, hypergeometric test ) 1  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs33692 | S2L | -2 | PF04502 | Breast Cancer | 21930502  21930507   | BIOMART |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs150087617 | E128D | Frequency |
| 2 | rs141808616 | R184Q | Cluster |
| 3 | rs144079143 | R205Q | Cluster |
| 4 | rs76970067 | N229T | Cluster |
| 5 | rs59055495 | P240S | Cluster,Frequency |
| 6 | rs149224144 | R257W | Frequency |
| 7 | rs143369003 | P284S | 1000Genome |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li