Protein sequence | ID you entered: ENSP00000264819 Ensembl protein: ENSP00000264819 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: MIER2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: mesoderm induction early response 1, family member 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29210] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.524242, hypergeometric test ) 2  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs34141 | T526M | -1 | Head and Neck Cancer | 21798893   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs147210482 | E19D | Frequency |
| 2 | rs138561665 | S55T | Frequency |
| 3 | rs7507468 | D68N | Cluster,Frequency |
| 4 | rs10421231 | D104N | Cluster |
| 5 | rs146065929 | R105W | Cluster,1000Genome |
| 6 | rs150312475 | Q140R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs149957445 | S142F | Frequency |
| 8 | rs112041836 | D145Y | Cluster |
| 9 | rs112041836 | D145N | Cluster |
| 10 | rs112041836 | D145H | Cluster |
| 11 | rs201881025 | P148L | Cluster,Frequency |
| 12 | rs187460465 | R166H | 1000Genome |
| 13 | rs149432677 | P189S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 14 | rs199568910 | A254T | Cluster |
| 15 | rs148482834 | R289W | Frequency |
| 16 | rs200376177 | P366L | Cluster |
| 17 | rs201519441 | R386H | Cluster |
| 18 | rs201519441 | R388H | Cluster |
| 19 | rs148132163 | T407M | Cluster,1000Genome |
| 20 | rs34129568 | P464S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 21 | rs35042658 | S485G | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 22 | rs139223158 | H524Q | Cluster |
No entry in dbDEPC was found |
| [ continue search ] |
Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li