Protein sequence | ID you entered: ENSP00000264820 Ensembl protein: ENSP00000264820 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: THEG | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: theg spermatid protein [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:13706] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.524242, hypergeometric test ) 2  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs35435 | E46K | 1 | Pancreatic Cancer | 21930502  21930507   | BIOMART |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs144685025 | R5K | Frequency |
| 2 | rs201566887 | R6* | 1000Genome |
| 3 | rs146082346 | S21L | Frequency |
| 4 | rs148047814 | R30H | Frequency |
| 5 | rs147806911 | E38K | Cluster,Frequency |
| 6 | rs112979308 | S39N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs61731230 | S39R | Cluster,Frequency |
| 8 | rs150024792 | R41Q | Cluster |
| 9 | rs189031212 | D51E | 1000Genome |
| 10 | rs61731231 | D79G | Cluster,Frequency |
| 11 | rs138095693 | R104Q | Cluster |
| 12 | rs142713592 | R122T | Frequency |
| 13 | rs188541504 | R123K | 1000Genome |
| 14 | rs138653079 | R125W | Cluster,1000Genome |
| 15 | rs150403020 | L131R | 1000Genome |
| 16 | rs145885147 | R152Q | Frequency |
| 17 | rs143878950 | T160A | Frequency |
| 18 | rs146544514 | R168C | Frequency |
| 19 | rs35119230 | R169C | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 20 | rs2303810 | R178I | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 21 | rs201142244 | N187D | Cluster |
| 22 | rs142879936 | R207H | Frequency |
| 23 | rs139003158 | M225V | 1000Genome |
| 24 | rs2278287 | R243Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 25 | rs10422863 | H273Y | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 26 | rs148350115 | S286L | Cluster,1000Genome |
| 27 | rs145185068 | K288N | Frequency |
| 28 | rs149765451 | R311Q | 1000Genome |
| 29 | rs3764656 | D329N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 30 | rs201450524 | R331C | Cluster,1000Genome |
| 31 | rs112813656 | A334T | Cluster |
| 32 | rs142373650 | Q350P | 1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li