Protein sequence | ID you entered: ENSP00000300960 Ensembl protein: ENSP00000300960 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: IZUMO4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: IZUMO family member 4 [Source:HGNC Symbol;Acc:26950] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs92082 | P197S | -1 | Brain Cancer | 21930502  21930507   | BIOMART | |||
| 2 | cs98599 | Q213K | 1 | Skin Cancer | 21984974   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs17851210 | A2T | Cluster |
| 2 | rs35585208 | F38L | Cluster,Frequency |
| 3 | rs147322963 | R131C | Frequency |
| 4 | rs45506200 | Y137F | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs146424829 | S148L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 6 | rs139812380 | S160L | Frequency |
| 7 | rs148904519 | G169D | Frequency |
| 8 | rs143536329 | W177G | Frequency |
| 9 | rs150988004 | T182M | Frequency |
| 10 | rs140848704 | P197S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 11 | rs147056920 | C210R | Frequency |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li