Protein sequence | ID you entered: ENSP00000301284 Ensembl protein: ENSP00000301284 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: AC011498.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: Hepatoma-derived growth factor-related protein 2 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q7Z4V5] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.434049, hypergeometric test ) 2  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs32825 | D30N | 1 | PF00855 | Skin Cancer | 21984974   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs147061912 | D112N | 1000Genome |
| 2 | rs148098363 | V125I | 1000Genome |
| 3 | rs76043051 | S190L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 4 | rs2288931 | P285S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs60970496 | R359H | Frequency,1000Genome |
| 6 | rs190117333 | R384P | 1000Genome |
| 7 | rs182131576 | R449W | 1000Genome |
| 8 | rs187761259 | R451Q | 1000Genome |
| 9 | rs192383970 | F457L | 1000Genome |
| 10 | rs180870155 | N562S | 1000Genome |
| 11 | rs62131001 | E579K | Frequency |
| 12 | rs189023720 | S630L | 1000Genome |
| 13 | rs117648883 | S669L | Frequency,1000Genome |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li