Protein sequence | ID you entered: ENSP00000301454 Ensembl protein: ENSP00000301454 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: SLC25A23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: solute carrier family 25 (mitochondrial carrier; phosphate carrier), member 23 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:19375] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.524242, hypergeometric test ) 2  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs73976 | F156L | 0 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC | |||
| 2 | cs66151 | F260L | 0 | PF00153 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC | ||
| 3 | cs75077 | M261R | -1 | PF00153 | Pancreatic Cancer | 21252315   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs150816117 | G65R | Frequency |
| 2 | rs183006878 | D67N | 1000Genome |
| 3 | rs141973094 | R73H | 1000Genome |
| 4 | rs138824668 | S124N | Cluster,Frequency |
| 5 | rs201973405 | H145Y | 1000Genome |
| 6 | rs202184533 | G192S | Cluster |
| 7 | rs138621235 | V198M | Frequency |
| 8 | rs201308330 | A217S | Cluster |
| 9 | rs151079430 | R239H | Frequency |
| 10 | rs192489049 | F260L | 1000Genome |
| 11 | rs4807869 | R310C | Cluster |
| 12 | rs61729423 | R324H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 13 | rs185375372 | E327D | 1000Genome |
| 14 | rs144612841 | W362* | 1000Genome |
| 15 | rs113342059 | H369Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 16 | rs200737083 | G383S | Cluster,1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li