Protein sequence | ID you entered: ENSP00000305603 Ensembl protein: ENSP00000305603 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: FUT3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: fucosyltransferase 3 (galactoside 3(4)-L-fucosyltransferase, Lewis blood group) [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:4014] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs91012 | I65M | 1 | PF00852 | Head and Neck Cancer | 21798893   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs28362458 | G5S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs145362171 | C16S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 3 | rs146199130 | A19T | Frequency |
| 4 | rs28362459 | L20R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs148881389 | R60H | Frequency |
| 6 | rs812936 | R68W | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs139654247 | R80H | Frequency |
| 8 | rs59796499 | Q102K | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 9 | rs778986 | M105T | Cluster,Frequency,1000Genome,HapMap |
| 10 | rs441610 | L137M | HapMap |
| 11 | rs149611774 | P141T | Cluster |
| 12 | rs407645 | Q144R | Cluster,Frequency |
| 13 | rs143012663 | L149M | Frequency |
| 14 | rs417341 | R151G | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 15 | rs28362462 | R160C | Cluster,Frequency |
| 16 | rs28362463 | D162N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 17 | rs3745635 | G170S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 18 | rs61734103 | P174L | Frequency |
| 19 | rs79852809 | P174L | Cluster |
| 20 | rs61744945 | P182S | Frequency |
| 21 | rs146519599 | P183L | Frequency |
| 22 | rs144569478 | G223R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 23 | rs28362466 | G223R | Cluster,Frequency |
| 24 | rs61730514 | K231Q | Frequency |
| 25 | rs140806726 | R240Q | 1000Genome |
| 26 | rs137909900 | V270M | Frequency |
| 27 | rs28381968 | V270M | Frequency |
| 28 | rs61737302 | V270M | Frequency |
| 29 | rs200332425 | R304G | Frequency |
| 30 | rs61745631 | R304G | Cluster,Frequency |
| 31 | rs61734104 | R321H | Frequency |
| 32 | rs138244391 | R321H | Frequency |
| 33 | rs778984 | R321H | Cluster,HapMap |
| 34 | rs150418165 | R323P | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 35 | rs28381969 | T325M | Cluster,Frequency |
| 36 | rs28381970 | R327Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 37 | rs151218854 | D336A | Frequency |
| 38 | rs61737304 | C341F | Cluster,Frequency |
| 39 | rs192187311 | T352M | 1000Genome |
| 40 | rs3894326 | I356K | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 41 | rs187397780 | A357P | 1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li