Protein sequence | ID you entered: ENSP00000309493 Ensembl protein: ENSP00000309493 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: GPRC6A | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: G protein-coupled receptor, class C, group 6, member A [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:18510] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr6 q22.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs61836 | M77I | 1 | PF01094 | Melanoma | 21499247   | COSMIC | ||
| 2 | cs14801 | I99N | -3 | PF01094 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC | ||
| 3 | cs94566 | K130T | -1 | PF01094 | Head and Neck Cancer | 21798893   | COSMIC | ||
| 4 | cs59327 | L262P | -3 | PF01094 | Head and Neck Cancer | 21798893   | COSMIC | ||
| 5 | cs79700 | D428G | -1 | PF01094 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC | ||
| 6 | cs81304 | Q519* | -4 | PF07562 | Skin Cancer | 21984974   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs78492331 | S18P | Frequency,1000Genome |
| 2 | rs148708177 | P33L | 1000Genome |
| 3 | rs6907580 | R57* | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 4 | rs2274911 | P91S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs185709000 | D101G | 1000Genome |
| 6 | rs28360548 | I144R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs145460545 | R187Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 8 | rs149304182 | A224S | Frequency |
| 9 | rs61745784 | V237M | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 10 | rs140603319 | I254T | Frequency |
| 11 | rs144964096 | H282R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 12 | rs117018536 | D371N | Frequency,1000Genome |
| 13 | rs140120868 | R382G | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 14 | rs187095771 | D401Y | 1000Genome |
| 15 | rs183900159 | L417I | 1000Genome |
| 16 | rs200889200 | R427W | Cluster |
| 17 | rs143913245 | F464Y | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 18 | rs138434111 | I482T | Cluster,1000Genome |
| 19 | rs80280966 | A492E | Cluster |
| 20 | rs143716393 | N510H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 21 | rs142066905 | P528S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 22 | rs35937022 | I599T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 23 | rs140601827 | L600F | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 24 | rs184216909 | K625I | 1000Genome |
| 25 | rs144698290 | Q655* | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 26 | rs191632433 | F657L | 1000Genome |
| 27 | rs118009892 | T679M | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 28 | rs139828071 | P704S | Frequency |
| 29 | rs142578038 | T712M | Cluster,Frequency |
| 30 | rs148099318 | I768M | Frequency |
| 31 | rs143644044 | F771Y | Frequency |
| 32 | rs149439793 | F771L | Frequency |
| 33 | rs146895917 | K772T | Frequency |
| 34 | rs139364930 | K772E | Frequency |
| 35 | rs148346142 | K774KKL | 1000Genome |
| 36 | rs188971795 | G787D | 1000Genome |
| 37 | rs147708254 | M788L | Frequency |
| 38 | rs142053954 | I843T | Frequency |
| 39 | rs191908044 | G876S | 1000Genome |
| 40 | rs142518238 | S885Y | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 41 | rs41291912 | S886G | Cluster,Frequency |
| 42 | rs144545899 | A902P | Frequency |
| 43 | rs41290852 | S924L | Cluster,Frequency,1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li