Protein sequence | ID you entered: ENSP00000319053 Ensembl protein: ENSP00000319053 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: ZNF77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: zinc finger protein 77 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:13150] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs94025 | R508H | 0 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs12610412 | C3S | HapMap,1000Genome,Cluster,Frequency |
| 2 | rs12609268 | I5V | HapMap,1000Genome,Cluster,Frequency |
| 3 | rs76204804 | V11G | Cluster |
| 4 | rs140838873 | P15S | Frequency |
| 5 | rs34603238 | L20W | Cluster,Frequency |
| 6 | rs140476712 | Q25* | 1000Genome |
| 7 | rs186272618 | S52G | 1000Genome |
| 8 | rs144419578 | Q57E | Frequency |
| 9 | rs114126245 | G64R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 10 | rs145532951 | N67S | 1000Genome |
| 11 | rs189959170 | R88G | 1000Genome |
| 12 | rs200864167 | T92A | Cluster |
| 13 | rs35699176 | Q100* | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 14 | rs34184381 | H132Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 15 | rs76396690 | C144F | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 16 | rs141883841 | C167Y | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 17 | rs34727043 | S175A | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 18 | rs34705382 | P179S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 19 | rs182952893 | T183M | 1000Genome |
| 20 | rs73527668 | V186I | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 21 | rs10423550 | Y202* | HapMap,1000Genome,Cluster,Frequency |
| 22 | rs201277177 | V203M | Cluster |
| 23 | rs35941441 | P224H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 24 | rs199713360 | G229V | Cluster |
| 25 | rs139212127 | R257W | Frequency |
| 26 | rs140137786 | R284* | 1000Genome |
| 27 | rs141673139 | P295L | Cluster |
| 28 | rs151130031 | T317M | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 29 | rs200559103 | H328R | Cluster |
| 30 | rs146879198 | R340* | Frequency |
| 31 | rs199562140 | T345M | Cluster |
| 32 | rs61740279 | R368* | Cluster,Frequency |
| 33 | rs182743134 | V427M | 1000Genome |
| 34 | rs35411355 | G460R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 35 | rs142625963 | P463R | Cluster,1000Genome |
| 36 | rs142625963 | P463L | Cluster,1000Genome |
| 37 | rs139829692 | A476D | Frequency |
| 38 | rs190727318 | Q480K | 1000Genome |
| 39 | rs34789013 | Y492* | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 40 | rs201394063 | T513M | Cluster |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li