Protein sequence | ID you entered: ENSP00000321731 Ensembl protein: ENSP00000321731 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: ANKRD24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: ankyrin repeat domain 24 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:29424] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.289088, hypergeometric test ) 3  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs42583 | R40C | -3 | Hepatocellular Carcinoma | 21930502  21930507   | BIOMART |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs143744058 | N59D | 1000Genome |
| 2 | rs61743270 | A66T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 3 | rs2052191 | A111T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 4 | rs146188452 | R198H | 1000Genome |
| 5 | rs61744768 | D209N | Frequency,1000Genome |
| 6 | rs7251041 | P240L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs117198027 | A287V | Frequency,1000Genome |
| 8 | rs149534927 | P302T | 1000Genome |
| 9 | rs12978469 | R349Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 10 | rs116237134 | H361Y | 1000Genome |
| 11 | rs145484612 | P435L | 1000Genome |
| 12 | rs148030082 | M459I | 1000Genome |
| 13 | rs61742307 | M475I | 1000Genome |
| 14 | rs141690693 | R500C | 1000Genome |
| 15 | rs201829878 | R500W | Cluster |
| 16 | rs61738959 | G558R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 17 | rs181048027 | A574S | 1000Genome |
| 18 | rs10413818 | E585K | HapMap,1000Genome,Cluster,Frequency |
| 19 | rs61741405 | T592A | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 20 | rs185531900 | K600E | 1000Genome |
| 21 | rs61742138 | G634E | Cluster,1000Genome |
| 22 | rs200312560 | T669M | Cluster |
| 23 | rs353693 | S684A | Cluster,Frequency,1000Genome,HapMap |
| 24 | rs200418117 | G691R | Cluster |
| 25 | rs12980998 | T785S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 26 | rs150106684 | E807Q | 1000Genome |
| 27 | rs142674065 | R921Q | 1000Genome |
| 28 | rs149730870 | A1078T | 1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li