Protein sequence | ID you entered: ENSP00000329697 Ensembl protein: ENSP00000329697 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: PPAP2C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: phosphatidic acid phosphatase type 2C [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:9230] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.379258, hypergeometric test ) 4  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs45171 | S162L | -2 | PF01569 | Breast Cancer | 21930502  21930507   | BIOMART | ||
| 2 | cs95550 | A201T | 0 | PF01569 | Central Nervous System Neoplasms | 18772396   | COSMIC | ||
| 3 | cs18192 | *310S | -4 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs183614327 | P26R | 1000Genome |
| 2 | rs150705131 | R55Q | Frequency |
| 3 | rs144086136 | G60R | Frequency |
| 4 | rs138517226 | D62V | Cluster |
| 5 | rs148329482 | V87I | Cluster,1000Genome |
| 6 | rs181354682 | S91L | 1000Genome |
| 7 | rs61745392 | R106C | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 8 | rs140076000 | R158Q | Cluster |
| 9 | rs185214238 | A176T | 1000Genome |
| 10 | rs201440917 | S187L | Cluster |
| 11 | rs199617258 | W210* | Cluster |
| 12 | rs201408221 | R214W | Cluster |
| 13 | rs61738956 | C262R | Cluster,Frequency |
| 14 | rs34708574 | R284W | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 15 | rs34392164 | P305S | Cluster,Frequency |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li