Protein sequence | ID you entered: ENSP00000330264 Ensembl protein: ENSP00000330264 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: TMPRSS9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: transmembrane protease, serine 9 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:30079] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs16579 | L144V | 1 | Ovarian Cancer | 18772890  21720365   | TCGA, COSMIC | |||
| 2 | cs79254 | P211L | -3 | PF00089 | Central Nervous System Neoplasms | 21163964   | COSMIC | ||
| 3 | cs81047 | S397F | -2 | PF00089 | Skin Cancer | 21984974   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs8100709 | T4A | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs185668001 | V11L | 1000Genome |
| 3 | rs142722059 | K16N | Frequency |
| 4 | rs891174 | S30T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs17685098 | R73W | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 6 | rs142862960 | R74W | Frequency |
| 7 | rs146586207 | T82M | Cluster |
| 8 | rs140023303 | T86I | Frequency |
| 9 | rs140728595 | L98F | Frequency |
| 10 | rs145333061 | R112Q | Frequency |
| 11 | rs141214525 | I131V | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 12 | rs141796619 | R153C | Cluster |
| 13 | rs201603131 | C166* | Cluster |
| 14 | rs150598683 | A187V | Frequency |
| 15 | rs200531836 | G201S | Cluster |
| 16 | rs117767265 | A218V | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 17 | rs146089494 | R221G | Frequency |
| 18 | rs143556680 | D250N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 19 | rs144060578 | T252M | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 20 | rs184338854 | S266L | 1000Genome |
| 21 | rs142962468 | R272W | Frequency |
| 22 | rs141038366 | V279I | Frequency |
| 23 | rs62120714 | R306Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 24 | rs201051608 | G330R | 1000Genome |
| 25 | rs148284151 | S360T | Frequency |
| 26 | rs141237109 | G363S | Frequency |
| 27 | rs138847400 | R369G | Frequency |
| 28 | rs147023760 | A415T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 29 | rs145109209 | R417H | Cluster,Frequency |
| 30 | rs150090870 | R428C | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 31 | rs10153474 | A456T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 32 | rs145686165 | A497G | Frequency |
| 33 | rs201661905 | C529* | Cluster |
| 34 | rs145601770 | A543T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 35 | rs147705810 | R577Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 36 | rs116272666 | I617T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 37 | rs147534568 | V622M | Frequency |
| 38 | rs45546534 | Q635R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 39 | rs143993870 | K656E | Cluster,Frequency |
| 40 | rs60568869 | S659T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 41 | rs144100598 | T722M | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 42 | rs139183825 | S746L | Cluster,Frequency |
| 43 | rs138523679 | T758M | Frequency |
| 44 | rs149635897 | T763R | Frequency |
| 45 | rs735911 | S793N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 46 | rs34615361 | G798R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 47 | rs191349620 | R835H | 1000Genome |
| 48 | rs184330957 | I934V | 1000Genome |
| 49 | rs7247162 | E938K | Cluster,1000Genome |
| 50 | rs141671587 | R1021Q | Cluster,1000Genome |
| 51 | rs147027818 | G1033S | Frequency |
| 52 | rs140960972 | H1038P | Frequency |
| 53 | rs7252121 | T1044I | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 54 | rs147580035 | W1052* | 1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li