Protein sequence | ID you entered: ENSP00000334784 Ensembl protein: ENSP00000334784 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: AZU1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: azurocidin 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:913] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.165392, hypergeometric test ) 1  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs69618 | R195H | 0 | PF00089 | Pancreatic Cancer | 21930502  21930507   | BIOMART |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs73919854 | Q20* | Cluster,1000Genome |
| 2 | rs148652041 | R103Q | Frequency |
| 3 | rs142169722 | D122Y | Frequency |
| 4 | rs140987452 | T146M | Frequency |
| 5 | rs28664760 | A155T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 6 | rs147872987 | T156M | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs28626600 | R172H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 8 | rs61732997 | G175E | Cluster,Frequency |
| 9 | rs149180756 | R176H | Frequency |
| 10 | rs61732996 | R179H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 11 | rs141614223 | N185K | Frequency |
| 12 | rs138374662 | R207H | 1000Genome |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li