Protein sequence | ID you entered: ENSP00000342422 Ensembl protein: ENSP00000342422 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: DCBLD1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: discoidin, CUB and LCCL domain containing 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:21479] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr6 q22.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.524242, hypergeometric test ) 2  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs58794 | G140R | -2 | PF00431 | Breast Cancer | 21930502  21930507   | BIOMART |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs117193276 | T71A | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs142641047 | V130I | Cluster,1000Genome |
| 3 | rs147487282 | P153S | Frequency |
| 4 | rs184790040 | R161* | 1000Genome |
| 5 | rs192563915 | R222C | 1000Genome |
| 6 | rs139193542 | R222H | Frequency |
| 7 | rs140824778 | G265R | Frequency |
| 8 | rs74499389 | K356R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 9 | rs138996885 | I387V | Frequency |
| 10 | rs182227121 | V388M | 1000Genome |
| 11 | rs138390701 | R424H | Cluster,1000Genome |
| 12 | rs146613111 | S447W | 1000Genome |
| 13 | rs58391332 | K485Q | Cluster |
| 14 | rs116943808 | M526L | Frequency,1000Genome |
| 15 | rs146929010 | R553T | 1000Genome |
| 16 | rs11153674 | R611L | HapMap,1000Genome,Cluster,Frequency |
| 17 | rs929059 | S657N | HapMap,1000Genome,Cluster,Frequency |
| 18 | rs182830982 | R667W | 1000Genome |
| 19 | rs210622 | L714F | Cluster,Frequency,1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li