Protein sequence | ID you entered: ENSP00000345102 Ensembl protein: ENSP00000345102 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: C19orf35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: chromosome 19 open reading frame 35 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:24793] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs92712 | *474G | -4 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs140660078 | P10S | Frequency |
| 2 | rs55662626 | P16S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 3 | rs141253643 | T23M | Cluster |
| 4 | rs145205195 | R66W | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs139309147 | R87Q | Frequency |
| 6 | rs147310621 | R87W | Cluster,1000Genome |
| 7 | rs201167235 | A119T | Cluster |
| 8 | rs184271660 | D127N | 1000Genome |
| 9 | rs73518414 | R147H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 10 | rs140574256 | L186P | Frequency |
| 11 | rs144004757 | R192H | 1000Genome |
| 12 | rs149444944 | A193V | Frequency |
| 13 | rs201422487 | L230M | Frequency |
| 14 | rs12609944 | S289I | HapMap |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li