Protein sequence | ID you entered: ENSP00000357588 Ensembl protein: ENSP00000357588 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: FAM26E | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: family with sequence similarity 26, member E [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:21568] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr6 q22.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs84886 | *310S | -4 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs76802220 | R32H | Cluster,1000Genome |
| 2 | rs140516625 | L65P | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 3 | rs189701030 | G101V | 1000Genome |
| 4 | rs34972589 | S134R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs201238364 | A177V | Cluster |
| 6 | rs199849392 | R202C | Cluster |
| 7 | rs370582612 | R204* | Cluster |
| 8 | rs34849495 | S213N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 9 | rs139416423 | D232N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 10 | rs200089126 | T258M | Cluster |
| 11 | rs35398770 | T298M | Cluster,Frequency,1000Genome |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li