Protein sequence | ID you entered: ENSP00000357615 Ensembl protein: ENSP00000357615 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: FRK | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: fyn-related kinase [Source:HGNC Symbol;Acc:3955] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr6 q22.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.274799, hypergeometric test ) 4  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs2485 | Y193* | -4 | PF00017 | Lung Cancer | 18428421  16140923  17344846   | Greenman2007 | ||
| 2 | cs8771 | R406H | 0 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 21930502  21930507  18948947   | Ding2008, BIOMART |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs148022890 | Y99F | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs34704018 | I100V | Cluster,Frequency |
| 3 | rs142770112 | G119A | Frequency |
| 4 | rs3756772 | G122R | HapMap,1000Genome,Cluster,Frequency |
| 5 | rs117605537 | D125E | Frequency,1000Genome |
| 6 | rs34064900 | S133L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs143351471 | V161I | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 8 | rs190975105 | T178M | 1000Genome |
| 9 | rs148594761 | V202L | 1000Genome |
| 10 | rs146859190 | N272S | 1000Genome |
| 11 | rs190064484 | R348Q | 1000Genome |
| 12 | rs146191498 | V362A | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 13 | rs185354663 | E392K | 1000Genome |
| 14 | rs149341971 | I393R | Frequency |
| 15 | rs12209851 | R451K | Cluster,Frequency |
| 16 | rs150528750 | E481V | 1000Genome |
| 17 | rs141525046 | R484H | 1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li