Protein sequence | ID you entered: ENSP00000371272 Ensembl protein: ENSP00000371272 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: PLIN5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: perilipin 5 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:33196] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs11060 | V153I | 3 | PF03036 | Head and Neck Cancer | 21798893   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs10407239 | A6V | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs185753001 | E101G | 1000Genome |
| 3 | rs200136383 | S111L | Cluster |
| 4 | rs201340592 | T113M | Cluster |
| 5 | rs199633236 | V141M | Cluster |
| 6 | rs201001165 | P167A | Cluster |
| 7 | rs199498374 | T169M | Cluster |
| 8 | rs116972497 | G202S | Frequency,1000Genome |
| 9 | rs1610090 | C255R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 10 | rs111442645 | R276G | Cluster |
| 11 | rs111442645 | R276W | Cluster |
| 12 | rs1062223 | R306W | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 13 | rs182486411 | A329T | 1000Genome |
| 14 | rs115387113 | A343V | 1000Genome |
| 15 | rs75748078 | R350C | Frequency,1000Genome |
| 16 | rs201650665 | A393V | Cluster |
| 17 | rs141998895 | A408V | 1000Genome |
| 18 | rs200856182 | Q444* | Cluster |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li