Protein sequence | ID you entered: ENSP00000371561 Ensembl protein: ENSP00000371561 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: ZNF555 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: zinc finger protein 555 [Source:HGNC Symbol;Acc:28382] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs97863 | E368K | 1 | Pancreatic Cancer | 21930502  21930507   | BIOMART | |||
| 2 | cs14875 | M470I | 1 | Breast Cancer | 21930502  21930507   | BIOMART |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs114482500 | A10T | 1000Genome |
| 2 | rs114346119 | K50N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 3 | rs141504383 | N116D | Frequency |
| 4 | rs111711826 | H128Y | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs36012545 | P136L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 6 | rs150058931 | E228K | 1000Genome |
| 7 | rs183888412 | Y255H | 1000Genome |
| 8 | rs190919658 | E368* | 1000Genome |
| 9 | rs183116863 | R383Q | 1000Genome |
| 10 | rs114206435 | N433S | Cluster,1000Genome |
| 11 | rs116375491 | T446A | 1000Genome |
| 12 | rs139670291 | Y507C | Cluster,1000Genome |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li