Protein sequence | ID you entered: ENSP00000384275 Ensembl protein: ENSP00000384275 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: STK11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: serine/threonine kinase 11 [Source:HGNC Symbol;Acc:11389] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.000619436, hypergeometric test ) 35  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs977 | Q37* | -4 | Lung Cancer | 18428421  15021901  12097271  18948947   17711506  16140923  17344846   | Ding2008, Greenman2007 | |||
| 2 | cs8647 | Q37L | -2 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | |||
| 3 | cs8640 | G56W | -2 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 4 | cs951 | Y60* | -4 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18428421  15077168  18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 5 | cs8643 | K78E | 1 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 6 | cs942 | R87K | 2 | PF00069 PF07714 | Skin Cancer | 18428421  17344846   | Greenman2007 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 7 | cs8646 | G91L | -4 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 8 | cs8637 | Q137* | -4 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 9 | cs980 | Q159* | -4 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18428421  18594528  18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 10 | cs8642 | E165* | -4 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 11 | cs970 | Q170* | -4 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18428421  18549475  10208439  18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 12 | cs970 | Q170* | -4 | PF00069 PF07714 | Skin Cancer | 18428421  18549475  10208439  18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 13 | cs8644 | K191* | -4 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 14 | cs8645 | G196V | -3 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 15 | cs936 | E199* | -4 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18428421  18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 16 | cs974 | Q220* | -4 | PF00069 PF07714 | Uterine Cancer | 18428421  18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 17 | cs974 | Q220* | -4 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18428421  18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 18 | cs8641 | D237Y | -3 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 19 | cs8638 | G242V | -3 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 20 | cs8648 | R304G | -2 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 | RPS6KA3, CAB39, RPS6KB1, | |
| 21 | cs8639 | A389T | 0 | Lung Cancer | 18948947   | Ding2008 |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs148830698 | R42Q | 1000Genome |
| 2 | rs121913323 | Q170* | Cluster |
| 3 | rs121913315 | D194N | Cluster |
| 4 | rs121913315 | D194Y | Cluster |
| 5 | rs185087320 | R211W | 1000Genome |
| 6 | rs121913322 | P281L | Cluster,1000Genome |
| 7 | rs59912467 | F354L | Cluster,Frequency,1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li