Protein sequence | ID you entered: ENSP00000430223 Ensembl protein: ENSP00000430223 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: ZNF57 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: zinc finger protein 57 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:13125] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs53402 | C309W | -2 | Pancreatic Cancer | 21930502  21930507   | BIOMART |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs148032465 | E3K | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs145789879 | V11I | Frequency |
| 3 | rs139501492 | N20S | Cluster,1000Genome |
| 4 | rs117724451 | S24A | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs143620899 | S24Y | Frequency |
| 6 | rs151095249 | H71R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 7 | rs187461635 | A103P | 1000Genome |
| 8 | rs61743150 | T118M | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 9 | rs61742111 | G155R | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 10 | rs117830102 | P176T | Cluster,1000Genome |
| 11 | rs117830102 | P176S | Cluster,1000Genome |
| 12 | rs183418172 | H182R | 1000Genome |
| 13 | rs189035490 | V183I | 1000Genome |
| 14 | rs2288958 | T191N | HapMap,1000Genome,Cluster,Frequency |
| 15 | rs145058495 | C197G | 1000Genome |
| 16 | rs2288957 | R198W | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 17 | rs149956507 | P260L | Frequency |
| 18 | rs61754927 | R265K | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 19 | rs150372606 | T271M | Cluster,1000Genome |
| 20 | rs138288250 | Y276C | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 21 | rs141285162 | R292Q | Frequency |
| 22 | rs184508498 | G300R | 1000Genome |
| 23 | rs55682587 | T325M | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 24 | rs149542472 | E333D | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 25 | rs140956395 | A368P | Frequency |
| 26 | rs149690257 | R376Q | Frequency |
| 27 | rs74837809 | Y388* | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 28 | rs142727006 | T411M | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 29 | rs148920572 | M465I | Cluster,Frequency,1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li