Protein sequence | ID you entered: ENSP00000440332 Ensembl protein: ENSP00000440332 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: HS3ST5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: heparan sulfate (glucosamine) 3-O-sulfotransferase 5 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:19419] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr6 q22.1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs33841 | *347S | -4 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC | |||
| 2 | cs60105 | *347C | -4 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs144143119 | A29T | Frequency |
| 2 | rs191330212 | I43T | 1000Genome |
| 3 | rs139315971 | L61P | Frequency |
| 4 | rs148289240 | A93V | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs144094472 | P114S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 6 | rs138458938 | K225Q | Cluster,Frequency |
| 7 | rs17793043 | I247N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 8 | rs150930343 | V253I | Frequency |
| 9 | rs140386644 | V269L | Frequency |
| 10 | rs149977661 | N344Y | 1000Genome |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li