Protein sequence | ID you entered: ENSP00000078429 Ensembl protein: ENSP00000078429 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: GNA11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 11 (Gq class) [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:4379] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.120134, hypergeometric test ) 13  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs60200 | R30W | -3 | PF00503 | Urinary Bladder Cancer | COSMIC | |||
| 2 | cs81378 | I56V | 3 | PF00503 | Intestines Cancer | 22895193   | COSMIC | ||
| 3 | cs65411 | K57Q | 1 | PF00503 | Gastric Cancer | COSMIC | |||
| 4 | cs23039 | G66S | 0 | PF00503 | Intestines Cancer | COSMIC | |||
| 5 | cs94419 | R114W | -3 | PF00503 | Breast Cancer | COSMIC | |||
| 6 | cs50168 | I132M | 1 | PF00503 | Lung Cancer | COSMIC | |||
| 7 | cs78604 | I132V | 3 | PF00503 | Lung Cancer | COSMIC | |||
| 8 | cs58814 | L135P | -3 | PF00503 | Gastric Cancer | COSMIC | |||
| 9 | cs58362 | R147H | 0 | PF00503 | Renal Cancer | COSMIC | |||
| 10 | cs81483 | V164I | 3 | PF00503 | Intestines Cancer | COSMIC | |||
| 11 | cs54745 | V164G | -3 | PF00503 | Intestines Cancer | 22895193   | COSMIC | ||
| 12 | cs10729 | R183L | -2 | PF00025 PF00503 | Intestines Cancer | COSMIC | |||
| 13 | cs3623 | R183C | -3 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | 23778528  23572068  23887304  24423917   22842228  21083380   | COSMIC | ||
| 14 | cs3623 | R183C | -3 | PF00025 PF00503 | Melanoma | COSMIC | |||
| 15 | cs98252 | R183H | 0 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer | 21083380   | COSMIC | ||
| 16 | cs92974 | M203L | 2 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | COSMIC | |||
| 17 | cs42611 | Q209K | 1 | PF00025 PF00503 | Prostate Cancer | 22722839   | COSMIC | ||
| 18 | cs11381 | Q209L | -2 | PF00025 PF00503 | Cancer | 21083380   | COSMIC | ||
| 19 | cs90047 | Q209H | 0 | PF00025 PF00503 | Head and Neck Cancer | 24633157   | COSMIC | ||
| 20 | cs52362 | Q209P | -1 | PF00025 PF00503 | Brain Cancer | 22307269   | COSMIC | ||
| 21 | cs11381 | Q209L | -2 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | 24714776  22236444  23778528  23456173   23887304  22977135  23861464   23634288  22817889  22842228   22569040  21874003  23793026   21083380  22515704  23934701   24423917  22758774  23464620   | COSMIC | ||
| 22 | cs11381 | Q209L | -2 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer | 21083380  23599145  23261261   | COSMIC | ||
| 23 | cs95645 | Q209* | -4 | PF00025 PF00503 | Intestines Cancer | COSMIC | |||
| 24 | cs52362 | Q209P | -1 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | 21083380  22977135  23778528   | COSMIC | ||
| 25 | cs11381 | Q209L | -2 | PF00025 PF00503 | Brain Cancer | 22421249  22758774   | COSMIC | ||
| 26 | cs41110 | Q209R | 1 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | 23934701   | COSMIC | ||
| 27 | cs11381 | Q209L | -2 | PF00025 PF00503 | Head and Neck Cancer | 21874003   | COSMIC | ||
| 28 | cs36388 | R214M | -1 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | 23778528   | COSMIC | ||
| 29 | cs45204 | E221Q | 2 | PF00025 PF00503 | Breast Cancer | COSMIC | |||
| 30 | cs51735 | V223A | 0 | PF00025 PF00503 | Intestines Cancer | COSMIC | |||
| 31 | cs60099 | V223M | 1 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | 20424519   | COSMIC | ||
| 32 | cs60099 | V223M | 1 | PF00025 PF00503 | Melanoma | 20424519   | COSMIC | ||
| 33 | cs66905 | Y235* | -4 | PF00025 PF00503 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC | ||
| 34 | cs3622 | R256W | -3 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | COSMIC | |||
| 35 | cs3622 | R256W | -3 | PF00025 PF00503 | Melanoma | COSMIC | |||
| 36 | cs20989 | N266K | 0 | PF00025 PF00503 | Melanoma | 20424519   | COSMIC | ||
| 37 | cs20989 | N266K | 0 | PF00025 PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | 20424519   | COSMIC | ||
| 38 | cs46605 | S268A | 1 | PF00025 PF00503 | Gastric Cancer | COSMIC | |||
| 39 | cs46661 | V269I | 3 | PF00025 PF00503 | Gastric Cancer | COSMIC | |||
| 40 | cs12561 | S286L | -2 | PF00503 | Gastric Cancer | 22484628   | COSMIC | ||
| 41 | cs23068 | F292V | -1 | PF00503 | Ovarian Cancer | COSMIC | |||
| 42 | cs52923 | P293S | -1 | PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | COSMIC | |||
| 43 | cs61354 | E294* | -4 | PF00503 | Breast Cancer | COSMIC | |||
| 44 | cs58224 | R306L | -2 | PF00503 | Lung Cancer | COSMIC | |||
| 45 | cs78511 | H327R | 0 | PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | COSMIC | |||
| 46 | cs40650 | D333N | 1 | PF00503 | Uterine Cancer | COSMIC | |||
| 47 | cs83619 | D333Y | -3 | PF00503 | Melanoma | 20424519   | COSMIC | ||
| 48 | cs83619 | D333Y | -3 | PF00503 | Skin Cancer(Melanoma) | 20424519   | COSMIC | ||
| 49 | cs80803 | V344M | 1 | PF00503 | Uterine Cancer | COSMIC | |||
| 50 | cs42474 | L351P | -3 | PF00503 | Gastric Cancer | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs147528229 | A65T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs74913870 | F84S | Cluster |
| 3 | rs191421665 | L170M | 1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li