Protein sequence | ID you entered: ENSP00000222033 Ensembl protein: ENSP00000222033 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: ZNRF4 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: zinc and ring finger 4 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:17726] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.286061, hypergeometric test ) 7  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs12624 | A208T | 0 | PF02225 | Head and Neck Cancer | 21798893   | COSMIC | ||
| 2 | cs86003 | D239N | 1 | Skin Cancer | 21984974   | COSMIC | |||
| 3 | cs57622 | V350M | 1 | PF00097 | Intestines Cancer | 17932254   | COSMIC | ||
| 4 | cs71496 | P377Q | -1 | Intestines Cancer | 17932254   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs78645830 | R5C | Cluster,1000Genome |
| 2 | rs144624511 | S14T | 1000Genome |
| 3 | rs200586901 | A20V | Cluster |
| 4 | rs2240743 | P37S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs199689222 | W73G | Cluster |
| 6 | rs2240744 | R78Q | Cluster,Frequency,1000Genome,HapMap |
| 7 | rs2240745 | V100I | Cluster,Frequency,1000Genome,HapMap |
| 8 | rs141487677 | R101Q | 1000Genome |
| 9 | rs149951234 | A118V | 1000Genome |
| 10 | rs61740899 | R130G | 1000Genome |
| 11 | rs182381348 | E146K | 1000Genome |
| 12 | rs8103406 | A157S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 13 | rs8107825 | V159A | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 14 | rs17304380 | R163H | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 15 | rs8104246 | R163C | HapMap,1000Genome,Cluster,Frequency |
| 16 | rs187068340 | G179S | 1000Genome |
| 17 | rs16992985 | D192N | Cluster,Frequency |
| 18 | rs114216623 | V214M | 1000Genome |
| 19 | rs145022317 | R300H | 1000Genome |
| 20 | rs199505275 | R380Q | Cluster |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li