Protein sequence | ID you entered: ENSP00000248244 Ensembl protein: ENSP00000248244 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: TICAM1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: toll-like receptor adaptor molecule 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:18348] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.0345598, hypergeometric test ) 19  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs3208 | M46I | 1 | Breast Cancer | 16959974   | HPI, COSMIC, Sjoblom2006 | |||
| 2 | cs36239 | S327F | -2 | Skin Cancer | 21984974   | COSMIC | |||
| 3 | cs88676 | F528L | 0 | Skin Cancer | 21984974   | COSMIC | |||
| 4 | cs36174 | Q612K | 1 | Skin Cancer | 21984974   | COSMIC | |||
| 5 | cs77365 | G675E | -2 | Breast Cancer | 21930502  21930507   | BIOMART |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs114566317 | T4I | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs79591246 | T32I | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 3 | rs11466719 | R75C | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 4 | rs139070404 | R114Q | 1000Genome |
| 5 | rs145148929 | S160F | Frequency |
| 6 | rs141394423 | R180C | Frequency |
| 7 | rs146550489 | S186L | Frequency |
| 8 | rs141739488 | D233H | 1000Genome |
| 9 | rs151272128 | G245S | Frequency |
| 10 | rs11466721 | L275V | HapMap |
| 11 | rs201243827 | S327P | 1000Genome |
| 12 | rs150740529 | A521T | Frequency |
| 13 | rs142171170 | Q534K | Frequency |
| 14 | rs143066432 | D557N | Frequency |
| 15 | rs139939816 | R560W | 1000Genome |
| 16 | rs143679494 | A568T | Frequency |
| 17 | rs146025102 | Y580C | 1000Genome |
| 18 | rs74359855 | G592R | Cluster,Frequency |
| 19 | rs113327885 | T623I | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 20 | rs3177471 | P628S | Cluster |
| 21 | rs11466724 | A666T | Cluster,Frequency |
| 22 | rs200326236 | A703T | Cluster |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li