Protein sequence | ID you entered: ENSP00000262958 Ensembl protein: ENSP00000262958 Protein sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: GNA15 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: guanine nucleotide binding protein (G protein), alpha 15 (Gq class) [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:4383] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.2544, hypergeometric test ) 6  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : ( pvalue=0.283431, hypergeometric test ) 1  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs56306 | E173K | 1 | PF00503 | Melanoma | 21499247   | COSMIC | ||
| 2 | cs58659 | P301S | -1 | PF00503 | Melanoma | 20424519   | COSMIC | ||
| 3 | cs94554 | E328K | 1 | PF00503 | Head and Neck Cancer | 21798893   | COSMIC | ||
| 4 | cs56029 | R366C | -3 | PF00503 | Melanoma | 21499247   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs75723333 | R3H | Cluster,1000Genome |
| 2 | rs139115108 | S114N | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 3 | rs149877401 | M117I | 1000Genome |
| 4 | rs76346810 | E168K | Cluster |
| 5 | rs199847220 | R169C | Cluster |
| 6 | rs143953630 | V182M | Cluster |
| 7 | rs2230330 | M187I | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 8 | rs151214875 | V199M | Frequency |
| 9 | rs143247880 | E283G | Frequency |
| NO. | dbDEPC_ID | change | ratio | cancer name | design | sample_control | sample_case | sample | pubmed |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | EXP00225 | ![]() | 0.02 | Breast Cancer | Normal vs. Cancer | 16N (normal) cells | NT cells (the primary tumor cells) | cell line | 20198662   |
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©2015 Menghuan Zhang, Jing Li