Protein sequence | ID you entered: ENSP00000269886 Ensembl protein: ENSP00000269886 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: SH3GL1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: SH3-domain GRB2-like 1 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:10830] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.0965681, hypergeometric test ) 20  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs83323 | G5R | -2 | Skin Cancer(Melanoma) | 23856246   | COSMIC | |||
| 2 | cs11786 | G23V | -3 | PF03114 | Gastric Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 3 | cs93365 | A24S | 1 | PF03114 | Urinary Bladder Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 4 | cs90582 | E25* | -4 | PF03114 | Lung Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 5 | cs11978 | E25K | 1 | PF03114 | Intestines Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 6 | cs92516 | A46V | 0 | PF03114 | Prostate Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 7 | cs39568 | T54I | -1 | PF03114 | Intestines Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 8 | cs67748 | S64L | -2 | PF03114 | Esophageal Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 9 | cs14211 | R65Q | 1 | PF03114 | Intestines Cancer | 22895193   | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | |
| 10 | cs32492 | K67M | -1 | PF03114 | Uterine Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 11 | cs35723 | K76N | 0 | PF03114 | Breast Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 12 | cs69580 | S89L | -2 | PF03114 | Skin Cancer(Melanoma) | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 13 | cs44066 | E103G | -2 | PF03114 | Liver Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 14 | cs45634 | M121I | 1 | PF03114 PF10455 | Skin Cancer(Melanoma) | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 15 | cs83354 | K122* | -4 | PF03114 PF10455 | Lung Cancer | 22980975   | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | |
| 16 | cs48369 | L143I | 2 | PF03114 PF10455 | Intestines Cancer | 22895193   | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | |
| 17 | cs21178 | E162K | 1 | PF03114 PF10455 | Urinary Bladder Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 18 | cs24193 | R164H | 0 | PF03114 PF10455 | Gastric Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 19 | cs14449 | Y170C | -2 | PF03114 PF10455 | Gastric Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 20 | cs27879 | E181K | 1 | PF03114 PF10455 | Skin Cancer(Melanoma) | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 21 | cs44944 | R184C | -3 | PF03114 PF10455 | Renal Cancer | 22385958   | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | |
| 22 | cs11167 | E188D | 2 | PF03114 PF10455 | Urinary Bladder Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 23 | cs85398 | A217T | 0 | PF03114 PF10455 | Uterine Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 24 | cs92112 | A221T | 0 | PF03114 PF10455 | Ovarian Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 25 | cs65833 | Y225D | -3 | PF03114 PF10455 | Ovarian Cancer | 20668451   | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | |
| 26 | cs96636 | Y225C | -2 | PF03114 PF10455 | Renal Cancer | COSMIC | SH3GL1, SH3GL3 | ||
| 27 | cs17559 | E254K | 1 | Uterine Cancer | COSMIC | ||||
| 28 | cs57197 | F263V | -1 | Liver Cancer | COSMIC | ||||
| 29 | cs25645 | E269Q | 2 | Intestines Cancer | COSMIC | ||||
| 30 | cs30550 | S271F | -2 | Urinary Bladder Cancer | COSMIC | ||||
| 31 | cs39445 | C277Y | -2 | Uterine Cancer | COSMIC | ||||
| 32 | cs78963 | R290* | -4 | Ovarian Cancer | 21720365   | COSMIC | |||
| 33 | cs55011 | R301W | -3 | Intestines Cancer | COSMIC | rs150284370 | |||
| 34 | cs87883 | P304S | -1 | Lung Cancer | 23033341   | COSMIC | |||
| 35 | cs59889 | P309L | -3 | Gastric Cancer | COSMIC | ||||
| 36 | cs56683 | P309S | -1 | Ovarian Cancer | 23780408   | COSMIC | |||
| 37 | cs14885 | E320K | 1 | PF07653 PF00018 | Gastric Cancer | COSMIC | SH2D4A, DNM1, SH3GL1, SH3 | ||
| 38 | cs77125 | I333M | 1 | PF07653 PF00018 | Lung Cancer | COSMIC | SH2D4A, DNM1, SH3GL1, SH3 |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs142802456 | L71F | 1000Genome |
| 2 | rs139264612 | R242C | Frequency |
| 3 | rs138726702 | A284T | 1000Genome |
| 4 | rs146037902 | I296T | Frequency |
| 5 | rs149527990 | R297W | Cluster |
| 6 | rs150284370 | R301W | Frequency |
| 7 | rs138715687 | E318Q | Cluster |
| 8 | rs150388848 | G350S | Cluster,Frequency,1000Genome |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li