Protein sequence | ID you entered: ENSP00000301264 Ensembl protein: ENSP00000301264 Protein sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: DAPK3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: death-associated protein kinase 3 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:2676] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.0580027, hypergeometric test ) 13  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : ( pvalue=0.100604, hypergeometric test ) 5  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs549 | T112M | -1 | PF00069 PF06293 PF07714 | Intestines Cancer | 21487036  18428421  17344846   | Greenman2007 | ||
| 2 | cs549 | T112M | -1 | PF00069 PF06293 PF07714 | Colorectal Cancer | 21487036   | HPI | ||
| 3 | cs551 | D161N | 1 | PF00069 PF06293 PF07714 | Ovarian Cancer | 21487036  18428421  17344846   | HPI, Greenman2007 | ||
| 4 | cs550 | P216S | -1 | PF00069 PF07714 | Lung Cancer | 21487036  18428421  21487036  17344846   | HPI, Greenman2007 |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs139511601 | R28W | Cluster |
| 2 | rs199986718 | R31W | Cluster |
| 3 | rs150676155 | E62Q | Frequency |
| 4 | rs141934386 | H73Y | Frequency |
| 5 | rs200475430 | S97C | Cluster |
| 6 | rs201446546 | K327E | Cluster |
| 7 | rs181345641 | A358T | 1000Genome |
| 8 | rs147011394 | S373N | Frequency |
| 9 | rs201287470 | R382W | Cluster |
| 10 | rs200352688 | E389K | Cluster |
| NO. | dbDEPC_ID | change | ratio | cancer name | design | sample_control | sample_case | sample | pubmed |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | EXP00015 | ![]() | 0.31 | Gastric Cancer | Metastasis | the noninvasive gastric cancer SC-M1 cell | the metastatic gastric cancer TMC-1 cells | cell line | 17022644   |
| 2 | EXP00186 | ![]() | 0.31 | Gastric Cancer | Metastasis | the noninvasive gastric cancer SC-M1 cell(a well-established human gastric carcinoma cell line, originally cultured from a poorly differentiated adenocarcinoma that invaded through the stomach wall but showed no metastasis to lymph nodes or adjacent organs) | the metastatic gastric cancer TMC-1 cells(derived from the lymph node of an individual with a moderately differentiated adenocarcinoma of the stomach and exhibited highly tumorigenic features) | cell line | 17022644   |
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©2015 Menghuan Zhang, Jing Li