Protein sequence | ID you entered: ENSP00000301281 Ensembl protein: ENSP00000301281 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: UBXN6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: UBX domain protein 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:14928] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.230295, hypergeometric test ) 7  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs69065 | R62W | -3 | Skin Cancer | 21984974   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs1127888 | A31P | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 2 | rs1127888 | A31T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 3 | rs200291730 | R69W | Cluster |
| 4 | rs146778894 | E98K | Cluster,1000Genome |
| 5 | rs112788696 | G129V | Cluster |
| 6 | rs112788696 | G129A | Cluster |
| 7 | rs112788696 | G129E | Cluster |
| 8 | rs193168940 | A139T | 1000Genome |
| 9 | rs145290718 | H188D | Cluster,1000Genome |
| 10 | rs141391502 | E190K | 1000Genome |
| 11 | rs148219784 | R195Q | Frequency |
| 12 | rs138342613 | I221T | Frequency |
| 13 | rs200629893 | T245S | Cluster |
| 14 | rs200629893 | T245I | Cluster |
| 15 | rs200898701 | T246S | Cluster |
| 16 | rs141014666 | V266M | Frequency |
| 17 | rs151060057 | A268T | Cluster |
| 18 | rs139717823 | R302P | Frequency |
| 19 | rs148557515 | A310V | 1000Genome |
| 20 | rs147364683 | R329W | Cluster |
| 21 | rs186322973 | V341M | 1000Genome |
| 22 | rs34179017 | A361V | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 23 | rs75122921 | V362G | Cluster |
| 24 | rs150530113 | L395W | Frequency |
| 25 | rs74788480 | E397K | Cluster,1000Genome |
| 26 | rs146350492 | A413G | Frequency |
| 27 | rs200555890 | V414M | Cluster |
| 28 | rs77077573 | A421V | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 29 | rs35436704 | P425L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 30 | rs149133767 | S427C | Frequency |
| 31 | rs138129036 | E432Q | Cluster,Frequency |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li