Protein sequence | ID you entered: ENSP00000307940 Ensembl protein: ENSP00000307940 Protein sequence | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: EEF2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: eukaryotic translation elongation factor 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:3214] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.0827795, hypergeometric test ) 50  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : ( pvalue=0.000000000269011, hypergeometric test ) 37  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs81330 | V137L | 1 | PF00009 | Head and Neck Cancer | 21798893   | COSMIC | EEF2 | |
| 2 | cs20762 | A508V | 0 | Skin Cancer | 21984974   | COSMIC | |||
| 3 | cs84326 | R633H | 0 | PF03764 | Head and Neck Cancer | 21798893   | COSMIC | EEF2 |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs76914868 | G52E | Cluster |
| 2 | rs35967493 | E80K | Cluster |
| 3 | rs145985140 | G95S | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 4 | rs2230560 | H108Q | Cluster,Frequency,1000Genome,HapMap |
| 5 | rs200480185 | G271S | Cluster |
| 6 | rs201085536 | I321V | Cluster |
| 7 | rs114174651 | I354M | 1000Genome |
| 8 | rs76252955 | V509G | Cluster |
| 9 | rs199771838 | E510G | Cluster |
| 10 | rs35805642 | H769Q | Cluster,Frequency,1000Genome |
| NO. | dbDEPC_ID | change | ratio | cancer name | design | sample_control | sample_case | sample | pubmed |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | EXP00024 | ![]() | Uterine Cancer | Normal vs. Cancer | Negative for Intraepithelial Lesions or Malignancy (NILM) | High-Grade Squamous Intraepithelial Lesion(HSIL) | tissue | 17902640   | |
| 2 | EXP00151 | ![]() | Hepatocellular Carcinoma | Cancer vs. Cancer (HCC vs. HuCCA) | hepatocellular carcinoma (HCC-S102, HepG2, SK-Hep-1, and Alexander) cell lines | cholangiocarcinoma (HuCCA-1) cell lines | cell line | 20069059   | |
| 3 | EXP00167 | ![]() | Lung Cancer | Cancer vs. Cancer | the M-BE cells(a SV40T-transformed human bronchial epithelial cell line with the phenotypic features of early tumorigenesis at high passage) at P40 passage | the M-BE cells (a SV40T-transformed human bronchial epithelial cell line with the phenotypic features of early tumorigenesis at high passage) at P140 and P200 passages | cell line | 17284061   | |
| 4 | EXP00233 | ![]() | Breast Cancer | Cancer vs. Cancer (Non-TNBC vs. TNBC) | a hormone-receptor-positive-Her2-negative (Non-TNBC, Case B) tumor specimen | triple negative breast cancer (TNBC, Case A) tumor specimen | cell line | 20596302   | |
| 5 | EXP00040 | ![]() | 0.34 | Leukemia | Normal vs. Cancer | control (CD34+ selected bone marrow cells) | Mixed lineage leukemia (MV4-11 cell line) | cell line | 17022645   |
| 6 | EXP00041 | ![]() | 0.34 | Leukemia | Normal vs. Cancer | control (CD34+ selected bone marrow cells) | Mixed lineage leukemia (RS4:11 cell line) | cell line | 17022645   |
| 7 | EXP00194 | ![]() | 0.42 | Gastric Cancer | Treatment (none vs. Vincristine-resistant) | human gastric carcinoma cell line SGC7901 | Vincristine-resistant human gastric carcinoma cell line SGC7901/VCR | cell line | 18253933   |
| 8 | EXP00320 | ![]() | 0.45 | Gastric Cancer | Normal vs. Cancer | precancerous, spasmolytic polypeptide EXPressing metaplasia(SPEM) | gastric adenocarcinoma | tissue | 15761955   |
| 9 | EXP00320 | ![]() | 0.5 | Gastric Cancer | Normal vs. Cancer | precancerous, spasmolytic polypeptide EXPressing metaplasia(SPEM) | gastric adenocarcinoma | tissue | 15761955   |
| 10 | EXP00222 | ![]() | 0.68 | Breast Cancer | Metastasis | noninvasive breast cancer cells (MCF-7) [Total Cell Proteomes] | invasive breast cancer cells (MB-MDA-231) [Total Cell Proteomes] | cell line | 20052998   |
| 11 | EXP00268 | ![]() | 0.8-11.4 | Renal Cancer | Normal vs. Cancer | normal renal cortex samples from patients | malignant RCC tissue samples from patients | tissue | 12923786   |
| 12 | EXP00221 | ![]() | 1.1 | Breast Cancer | Normal vs. Cancer | normal breast cells (MCF-10A) [Total Cell Proteomes] | invasive breast cancer cells (MB-MDA-231) [Total Cell Proteomes] | cell line | 20052998   |
| 13 | EXP00054 | ![]() | 1.3 | Oral Premalignant Lesions | Normal vs. Cancer | normal oral tissues 1 | oral premalignant lesions (OPLs) tissues 1 | tissue | 19072117   |
| 14 | EXP00059 | ![]() | 1.3 | Oral Premalignant Lesions | Normal vs. Cancer | normal oral tissues 6 | oral premalignant lesions (OPLs) tissues 6 | tissue | 19072117   |
| 15 | EXP00058 | ![]() | 1.4 | Oral Premalignant Lesions | Normal vs. Cancer | normal oral tissues 5 | oral premalignant lesions (OPLs) tissues 5 | tissue | 19072117   |
| 16 | EXP00309 | ![]() | 1.4 | Gastric Cancer | Treatment (none vs. drug-resistant) | gastric cancer SGC7901 cells | drug-resistant SGC7901 cells (SGC7901/VCR) | cell line | 20625496   |
| 17 | EXP00021 | ![]() | 1.5 | Prostate Cancer | Treatment (none vs. bicalutamide treatment) | androgen (R1881) on the androgen-responsive prostate cancer LNCaP cell line | anti-androgen (bicalutamide) on the androgen-responsive prostate cancer LNCaP cell line | cell line | 17152098   |
| 18 | EXP00055 | ![]() | 1.5 | Oral Premalignant Lesions | Normal vs. Cancer | normal oral tissues 2 | oral premalignant lesions (OPLs) tissues 2 | tissue | 19072117   |
| 19 | EXP00220 | ![]() | 1.6 | Breast Cancer | Normal vs. Cancer | normal breast cells (MCF-10A) [Total Cell Proteomes] | noninvasive breast cancer cells (MCF-7) [Total Cell Proteomes] | cell line | 20052998   |
| 20 | EXP00341 | ![]() | 1.6 | Pancreatic Cancer | Treatment (Gemcitabine-sensitive vs. Gemcitabine-resistant) | GEM sensitive human pancreatic adenocarcinoma cell line KLM1 | GEM-resistant human pancreatic adenocarcinoma cell line KLM1-R | cell line | 20944110   |
| 21 | EXP00292 | ![]() | 1.7 | Ovarian Cancer | Treatment (Paclitaxel-sensitive vs. Paclitaxel-resistant) | Paclitaxel Sensitive A2780 Epithelial Ovarian Cancer Cell Line | Paclitaxel Resistant A2780TC1 Epithelial Ovarian Cancer Cell Line | cell line | 19714814   |
| 22 | EXP00021 | ![]() | 1.9 | Prostate Cancer | Treatment (none vs. bicalutamide treatment) | androgen (R1881) on the androgen-responsive prostate cancer LNCaP cell line | anti-androgen (bicalutamide) on the androgen-responsive prostate cancer LNCaP cell line | cell line | 17152098   |
| 23 | EXP00292 | ![]() | 2.1 | Ovarian Cancer | Treatment (Paclitaxel-sensitive vs. Paclitaxel-resistant) | Paclitaxel Sensitive A2780 Epithelial Ovarian Cancer Cell Line | Paclitaxel Resistant A2780TC1 Epithelial Ovarian Cancer Cell Line | cell line | 19714814   |
| 24 | EXP00100 | ![]() | 2.2 | Breast Cancer | Treatment (none vs. 17b-Estradiol treatment) | MCF-7 human breast cancer cells | "MCF-7 human with 17b-Estradiol treatment breast cancer cells" | cell line | 18491314   |
| 25 | EXP00021 | ![]() | 2.4 | Prostate Cancer | Treatment (none vs. bicalutamide treatment) | androgen (R1881) on the androgen-responsive prostate cancer LNCaP cell line | anti-androgen (bicalutamide) on the androgen-responsive prostate cancer LNCaP cell line | cell line | 17152098   |
| 26 | EXP00021 | ![]() | 2.7 | Prostate Cancer | Treatment (none vs. bicalutamide treatment) | androgen (R1881) on the androgen-responsive prostate cancer LNCaP cell line | anti-androgen (bicalutamide) on the androgen-responsive prostate cancer LNCaP cell line | cell line | 17152098   |
| 27 | EXP00102 | ![]() | 2.9 | hepatitis B virus | Normal vs. Cancer | surrounding nontumorous liver tissues | hepatitis B surface antigen-positive (B-type HCC) | tissue | 14654528   |
| 28 | EXP00103 | ![]() | 2.9 | hepatitis C virus | Normal vs. Cancer | surrounding nontumorous liver tissues | anti-HCV-positive (C-type HCC) | tissue | 14654528   |
| 29 | EXP00104 | ![]() | 2.9 | Hepatocellular Carcinoma | Normal vs. Cancer | surrounding nontumorous liver tissues | hepatitis B surface antigen-negative and anti-HCV-negative | tissue | 14654528   |
| 30 | EXP00341 | ![]() | 3.1 | Pancreatic Cancer | Treatment (Gemcitabine-sensitive vs. Gemcitabine-resistant) | GEM sensitive human pancreatic adenocarcinoma cell line KLM1 | GEM-resistant human pancreatic adenocarcinoma cell line KLM1-R | cell line | 20944110   |
| 31 | EXP00216 | ![]() | 6.2 | Breast Cancer | Normal vs. Cancer | normal interstitial fluids (NIF) from prospective breast cancer patients | tumour interstitial fluids (TIF) from prospective breast cancer patients | tissue | 20005186   |
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©2015 Menghuan Zhang, Jing Li