Protein sequence | ID you entered: ENSP00000317912 Ensembl protein: ENSP00000317912 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: STAP2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: signal transducing adaptor family member 2 [Source:HGNC Symbol;Acc:30430] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.120145, hypergeometric test ) 10  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs75512 | E161A | -1 | Central Nervous System Neoplasms | 18772396   | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs7247504 | D93N | Cluster,Frequency,1000Genome,HapMap |
| 2 | rs143484969 | R146C | Frequency |
| 3 | rs79657645 | Y169* | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 4 | rs79097338 | V187L | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 5 | rs146537896 | C281R | Frequency |
| 6 | rs144306660 | T282I | Frequency |
| 7 | rs143576049 | S330A | Frequency |
| 8 | rs138002546 | A346G | Frequency |
No entry in dbDEPC was found |
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Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li