Protein sequence | ID you entered: ENSP00000337332 Ensembl protein: ENSP00000337332 Protein sequence | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Name: SIRT6 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description: sirtuin 6 [Source:HGNC Symbol;Acc:HGNC:14934] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Location: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
chr19 p13.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene Ontology: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Biological process  Molecular function  Cellular localization  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interactions: ![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer_related variations : ( pvalue=0.199028, hypergeometric test ) 10  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Interaction partner with cancer related differentially expressed proteins : NA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
![]() | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| NO. | csID | variation | change conservation+ | Domain | cancer name | PubMed | data source++ | validated dbSNP* | interface |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | cs3304 | G8E | -2 | Melanoma | COSMIC |
+Conservation of amino acid substitutions are defined here according to the BLOSUM62 matrix, conservative changes were those having a positive or neutral sign in the matrix, whereas non-conservative changes were those having a negative value (Cargill, et al. 1999). ++Data sources: HPI, COSMIC, OMIM, TCGA, BIOMART, Greenman2007, Sjoblom2006, Ding2008 *Cross-reference databases: dbSNP Interface information was collected from Wang 2012 |
| NO. | dbSNP_ID | variation | validated |
|---|---|---|---|
| 1 | rs352493 | S46N | Cluster,Frequency,1000Genome,HapMap |
| 2 | rs138839184 | A58T | Cluster |
| 3 | rs199849196 | F86S | Cluster |
| 4 | rs200742459 | R90W | Cluster |
| 5 | rs200364417 | V149I | Cluster |
| 6 | rs114189165 | R150Q | 1000Genome |
| 7 | rs149957544 | E202K | Frequency |
| 8 | rs191314480 | G223R | 1000Genome |
| 9 | rs200395703 | N224T | Cluster |
| 10 | rs147362434 | R235H | Cluster |
| 11 | rs74317014 | A275T | Cluster,Frequency,1000Genome |
| 12 | rs183444295 | A313S | 1000Genome |
| 13 | rs192661013 | H342D | 1000Genome |
| 14 | rs201974715 | K346R | Cluster |
No entry in dbDEPC was found |
| [ continue search ] |
Dr. Jing Li's Group
©2015 Menghuan Zhang, Jing Li